西奈山的科学家与西班牙马德里卡洛斯三世健康研究所 (ISCIII) 的研究人员合作，发现并确定了猴痘病毒基因组的变化，这些变化可能与 2022 年爆发中观察到的病毒传播能力的变化有关。研究结果发表在 4 月 18 日的《自然通讯》杂志上。
猴痘病毒（MPXV）是一种双链DNA病毒，可以感染动物和人类。 MPXV 会引起一种称为 MPOX 的疾病，症状包括发烧、淋巴结肿大和皮疹。大多数病例都是轻微的，并且往往会自行好转；然而，MPOX 可能会非常疼痛，并可能导致永久性疤痕。 MPXV 于 1958 年首次在进口到比利时的食蟹猕猴中发现，自 20 世纪 70 年代以来，MPXV 在中非和西非引起了零星的人类疾病爆发。 2022 年 5 月，包括美国在内的多个国家报告了 MPXV 感染和相关疾病数量不断增加，其中包括可能与比利时、西班牙和英国超级传播事件有关的聚集性病例。尽管与 2022 年溢出效应相关的新病例数量随着时间的推移有所减少，但未接种疫苗的个体中仍然存在该疾病病例，其中中部非洲目前由于新的溢出效应而出现病例增加。随着病毒在人类中传播的增加，出现能够在人群中流行的更具传染性的变种的风险也在增加。
“生物准备和病毒学监测涉及研究有利于人畜共患病溢出和促进人际传播的原因。当我们观察到猴痘等病毒的基本流行病学特征发生显着变化时，应该会重新激发我们了解这些传播条件的兴趣。目前非洲发生的病例数量不断增加，以及 2022 年的疫情，应该是明确的警报信号，”西奈山伊坎医学院微生物学教授、该研究的资深作者 Gustavo Palacios 博士说。
为了开展这项研究，研究人员分析了 46 名感染 MPXV 的患者的样本，这些患者的诊断和测序是在 2022 年 MPX 爆发之初在 ISCIII 进行的。研究小组对每位研究参与者的完整猴痘病毒基因组进行了高质量测序，以确定不同序列组的基因组变异之间可能存在的相关性，以及与病毒进化、传播和感染能力相关的流行病学联系。
研究小组表示，反复观察到的基因组变化位于可能与病毒适应相关的基因组区域。这些特定位置将有助于调节病毒复制周期、适应性以及进出路径。这些改变出现在被称为低复杂性基因组区域的区域，这些区域特别难以测序和分析，这解释了为什么它们以前被忽视。这种高度复杂的完整基因组测序是通过使用两种先进的测序技术实现的：单分子长读长测序（覆盖高度重复的区域）和深度短读长测序（以提供准确性和深度）。
通过详细描述这些重复基因组序列中的基因组改变并将它们与关键病毒功能联系起来，研究人员为 2022 年 MPOX 爆发期间观察到的传播性增强提供了合理的解释。
帕拉西奥斯博士说：“这些发现可能提供了第一个线索，帮助我们了解与持续人际传播相关的菌株的独特特征，而这种特征在这些病原体中尚未观察到。” “更好地了解促进病毒传播并影响其临床表现的途径将使我们能够制定更有效的预防和治疗策略。”
